工程硕士教育侧重于工程素质培养和工程实践能力训练;工学硕士是我们一般所说的统招工科类研究生，侧重于基础理论学习和学术研究。
从培养特色上，一是工程硕士侧重动手、实践技能，而工学硕士侧重学术性、研究能力;
二是工程硕士入学要求(特别是考试)更适合有实践经验的生源;
三是工程硕士学位授予更适合面向解决实际问题的人才(如不严格要求工作独创性，学术论文发表等，而是侧重考察解决工程实际问题的能力)。
| 类别 | 生源结构 | 选拔方式 | 培养特征 | 课程学习 | 教学模式 | 论文指导 | 经费来源 | 毕业去向 |
| 工程硕士 | 工程技师和工程管理人员 | 全国联考GCT与高校自行组织考试相结合的两段制考试，高校自主招生录取 | 偏重于工程应用能力培养 | 以面授为主，网络教学为辅，采取分段学习、集中授课、分散消化的方式，因地制宜，灵活安排 | 进校不离岗；边学习，边工作 | 企业课题，学校和企业的双导师 | 学校、企业、个人分担制 | 服务于企业 |
| 工学硕士 | 社会生源 | 全国统考 高校在国家确定的分数线内招生录取 | 偏重于科研能力培养 | 全部面授，在教室集中学习 | 进校全脱产学习 | 学校导师课题、学校导师 | 以国家拨款为主 | 多服务与高校与科研单位 |
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